2013年中国科学院超级计算中心分子模拟软件
NAMD讲习班通知
为普及和推广高性能计算和分子模拟理论、培养分子模拟专业人才和软件开发人才,中国科学院超级计算中心、美国伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校物理系理论与计算生物物理学研究组、中国科学院生物物理研究所将于2013年10月14~17日在北京联合举办2013年分子模拟软件NAMD讲习班。
NAMD(NAnoscale Molecular Dynamics)是由美国伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校理论与计算生物物理学研究组开发的一款并行分子动力学模拟计算代码,是主要用来研究大分子体系的高性能分子模拟软件。NAMD根据经典的力场理论数字解离子的运动方程研究原子的运动轨迹。其中力场包括Amber、CHARMM和Dreiding。Dreiding力场的引入使用户不仅从NAMD的高性能计算中得到实惠,而且还通过分子动力学计算预测扩散系数、结合能等重要性质。NAMD主要用来研究生物分子体系模拟,可以在高端服务器的上千个处理器上进行高性能并行计算,并行效率非常好,可以处理大分子体系。
本次培训将面向NAMD软件使用、本着“理论指导实践、学以致用、加强交流”目的,利用中科院超算中心高性能计算机系统“深腾7000”所提供的一流高性能计算软硬件环境,为广大学员带来高性能计算化学的深度体验。我们特邀来自著名分子模拟软件NAMD软件开发团队、美国伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校物理系理论与计算生物物理学研究组的刘彦欣博士担任主讲教师,同时兼顾计算化学、计算生物和蛋白质研究前沿研究的热点科学问题。培训期间我们将为广大学员提供上机实践的机会。
- 培训对象:深腾7000用户、从事计算化学、计算生物等研究的科研院所和高校教师、研究生、科研工作人员及相关企业工程师。
- 培训时间:2013年10月14日~17日,报名截止时间:2013年10月8日,名额有限,报名从速。
- 培训费用:包括教材费、培训费、上机费、午餐费
- 培训地点:中国科学院计算机网络信息中心514教室
- 报名方式
- 付款信息
- 拟定培训内容(详见课程安排,如有变更,请以实际培训为准):
- 分子模拟理论知识
- 分子模拟软件NAMD使用方法
- NAMD软件上机实践、软件安装编译
- NAMD软件科研应用实例
- NAMD软件二次开发
- 中国科学院超级计算环境使用介绍
- 乘车路线:
- 首都机场:机场巴士(首都机场—中关村)终点(即四环保福寺桥)下车,换乘公交641、619路到海淀交通支队站下车;或乘机场快线轻轨到三元桥站,换乘地铁10号线西行到知春路站下车;
- 北京西站: 公交319路到海淀交通支队站下车;
- 北京站: 地铁2号线到西直门站,换乘城铁13号线到知春路站下车。
- 北京南站: 地铁4号线到海淀黄庄站,换乘10号线东行到知春路站下车。
- 住宿推荐
- 报名回执表
科研单位学员:¥2000元/人
企业单位学员:¥3000元/人
2013年9月30日之前报名并汇款的学员,培训费用每人优惠200元。
详细地址:北京市海淀区中关村南四街四号中国科学院软件园区2号楼

请按照报名回执表的要求填写各项内容,然后发邮件到liuqian@sccas.cn,我们将在一个工作日之内回复。
联系人:刘倩博士,联系电话:010-58812143。
电汇(推荐):截止日期2013年10月10日(含)。汇款时请注明“超算计算化学培训”,凭汇款单在签到时领取发票(发票项目:培训费)。
收款单位全称:中国科学院计算机网络信息中心
开户行名称:中国工商银行海淀支行营业部
账号:0200 0496 0920 0016 431
现场付款: 签到当天可以直接用现金或支票付款,并开具发票
附近公交站点:海淀交通支队、知春里东站
地铁站点: 知春路站
具体路线请查询:http://www.bjbus.com/index.htm
宾馆名称 | 联系电话 | 地 址 | 备 注 |
物科宾馆 | 010-82649482 | 中关村南三街8号(中国科学院物理所院内) | 需提前预订;
步行时间:15分钟之内。 |
天创宾馆 | 010-51192000 | 中关村南一条甲1号 | 需提前预订; 步行时间:10分钟之内。 |
康拓宾馆 | 010-68378288 010-62634975 |
中关村南一条甲4号 | 需提前预订;
步行时间:10分钟之内 |
中国科学院空间会议中心 | 010-62582916 | 中关村南二条甲1号 | 需提前预订;
步行时间:8分钟之内 |
青年公寓2号楼地下招待所 | 010-82680799 | 中关村东路80号(中国科学院研究生院青年公寓) | 需提前预订;
步行时间:8分钟之内 |
*以实际报价为准
姓名 | 性别 | 工作单位 | 职务/职称 | 办公电话 | 手机 | 开发票单位名称 | 备注 | |
注:各个字段都是必填项,请正确填写,以便联络,谢谢!